SciTE使用文本配置文件，具有极强的可配置性。可以对各类语言和项目设置不同的配置，也可以简单的使用全局配置。配置选项涉及文本的高亮、缩进、折叠、字体等，还可以定制快捷键。通过编写自己的配置文件，用户还可以对自定义的文件类型添加高亮、缩进、编译等功能。详细的设置可参阅SciTE的配置说明[2]。

另外，SciTE并不支持宏语言，而支持一个更为强大的脚本语言——Lua，通过这一语言用户可以极大的个性化设置自己的编辑器，例如可以通过Scintilla的API直接访问SciTE的缓存，定制快捷键或者响应事件。最新的版本SciTE进一步加强了对Lua的支持，用户可以使用Lua轻易的添加对其他程序和特殊需求的功能，比如对ctags的支持，或者双击自动选择所有注释等功能。网络上现在已经有很多Lua脚本的SciTE扩展实现[3]，用户可以参照实现自己的脚本，也可直接使用。

现在比较有名的基于SciTE的程序实现，包括Scite4AutoIt3、SciTE4AutoHotkey 和 SciTE LaTeX IDE等。